Permanent merkintäkynät jakautuvat xyleeniä sisältävin tai xyleenittömiin markkereihin. Xyleenipohjaiset markkerit soveltuvat erityisesti muovi- (ei styrox), kumi-, metalli-, lasi-, kivi-, puu- ja sementtipinnoille. Xyleenin ansiosta väri kiinnityy erittäin voimakkaasti.
Spriiliukoiset markkerit, joiden väriaine ei sisällä xyleeniä, soveltuvat lähes kaikille pinnoille, erityisesti paperi-, kartonki-, muovi-, kumi-, nahka-, metalli-, lasi-, kivi- ja styroxpinnoille. Öljypohjaiset permanent markkerit ovat xyleenitön vaihtoehto, jonka mietotuoksuinen väriaine käy lähes kaikille pinnoille.
Tekstiilien merkintään suositellaan erikoismarkkereita.
